Nhà thờ Chính thống Nhật Bản, cơ quan tự trị của Giáo hội Chính thống Đông phương, trong mối quan hệ kinh điển với tộc trưởng Moscow, nơi xác nhận cuộc bầu cử của đô thị Tokyo. Nhà thờ Chính thống Nhật Bản được thành lập bởi nỗ lực của một nhà truyền giáo kiệt xuất, Nikolay Kasatkin (1836,1912), người trở thành tổng giám mục Chính thống đầu tiên của Nhật Bản và được phong thánh vào năm 1970.
Kể từ khi bắt đầu nhiệm vụ (1872), nhà thờ không bao giờ phụ thuộc vào nhân viên truyền giáo nước ngoài. Các linh mục Nhật Bản được thụ phong sau khi được đào tạo trong một chủng viện ở Tokyo, và một hội đồng giáo sĩ và giáo dân có toàn quyền kiểm soát các công việc của nhà thờ. Nhân vật bản địa này của Chính thống giáo Nhật Bản đã cho phép nó sống sót qua nhiều thử thách chính trị và thời kỳ cô lập, như Chiến tranh Nga-Nhật và hai cuộc Chiến tranh Thế giới. Từ năm 1945 đến 1970, nhà thờ thuộc thẩm quyền giáo hội của vùng đô thị Nga của Mỹ. Năm 1970, nó đã nhận được một đạo luật tự trị vĩnh viễn từ tộc trưởng Moscow, nhà thờ mẹ của nó. Nhà thờ Chính thống giáo Tokyo Tokyo được gọi là Nhà thờ Nikolay, đối với người sáng lập, Nikolay Kasatkin, là một trong những công trình tôn giáo lớn nhất ở thủ đô của Nhật Bản. Nhà thờ, với số lượng khoảng 30.000 thành viên, có các giáo phận ở Tokyo, Kyōto và Sendai.
