Cuộc đấu tranh giải phóng ở Tanganyika được lãnh đạo bởi Liên minh Quốc gia Châu Phi Tanganyika, với lá cờ là một màu xanh lá cây ngang màu xanh lá cây-đen-xanh. Các cuộc bầu cử đã xác nhận sự ủng hộ phổ biến áp đảo đối với tổ chức này và chính quyền Anh đề nghị sửa đổi cờ đảng để sử dụng làm quốc kỳ sau khi giành độc lập vào ngày 9 tháng 12 năm 1961. Tiền thưởng vàng đã được thêm vào thời điểm đó.
Dưới thời Ả Rập, Zanzibar đã treo cờ đỏ từ lâu, nhưng một chế độ châu Phi đen đã lên nắm quyền vào ngày 12 tháng 1 năm 1964, dưới một lá cờ màu đen, vàng và xanh. Tháng sau, đảng Afro-Shirazi cầm quyền đã giới thiệu một lá cờ quốc gia mới tương tự như của chính họ. Các sọc ngang màu xanh-đen-xanh lá cây tương ứng là biển, con người và đất liền, trong khi một dải dọc màu trắng hẹp ở tời là vì hòa bình.
Vào tháng 4 năm 1964, các quốc gia Tanganyika và Zanzibar đã hợp nhất, và vào đầu tháng 7, truyền thống cờ của họ đã được kết hợp để tạo ra quốc kỳ mới của Tanzania. Các màu cờ được kết hợp theo đường chéo cho sự khác biệt. Phần lớn dân số của đất nước được biểu tượng bằng dải màu đen, trong khi màu xanh lá cây cho thấy tài nguyên nông nghiệp phong phú của vùng đất. Sự giàu có về khoáng sản được phản ánh trong các biên giới màu vàng hẹp, trong khi Ấn Độ Dương được tượng trưng bằng màu xanh. Sau khi Zanzibar hợp nhất với Tanganyika, cờ Zanzibar vẫn tiếp tục được sử dụng tại địa phương trên các đảo đó.
