Âm mưu của Công giáo và Armada Tây Ban Nha
Những nỗ lực bí mật đó sẽ dẫn trực tiếp đến việc vạch trần hai âm mưu nghiêm trọng hơn nhằm hạ bệ Elizabeth và khôi phục Công giáo cho Anh. Một điệp viên của Đại sứ quán Pháp tại Luân Đôn, người được xác định là Giordano Bruno (viết theo bút danh Henry Fagot), một tu sĩ Dominican mất hiệu lực, người sau này sẽ nổi tiếng với tư cách là một triết gia nổi tiếng của thời Phục hưng Ý. Mary đã được chuyển qua đại sứ quán. Cốt truyện đã bị phá vỡ với vụ bắt giữ tù trưởng, ông Francis Throckmorton, vào tháng 11 năm 1583. Trong tài sản của ông ta là các tài liệu liên quan, bao gồm một bản đồ các cảng xâm lược và một danh sách những người ủng hộ Công giáo ở Anh. Bị tra tấn, Throckmorton tiết lộ kế hoạch xâm chiếm nước Anh của quân đội Tây Ban Nha và Pháp trong buổi hòa nhạc với sự gia tăng của các tín đồ của Mary. Đại sứ Tây Ban Nha bị trục xuất và liên lạc ngoại giao với Tây Ban Nha bị cắt đứt.
Âm mưu thứ hai, Âm mưu Babington (được đặt theo tên của kẻ chủ mưu Anthony Babington), đã bị vạch trần vào tháng 8 năm 1586 với sự trợ giúp của các đặc vụ đôi và các chuyên gia mã của Walsingham, những người không biết đến các đặc vụ của Mary, đã thực sự cung cấp phương tiện giao tiếp với Mary qua các lá thư được mã hóa. nhập lậu trong một thùng bia. Những lá thư đã xác lập sự đồng lõa của Mary trong nỗ lực hạ bệ Elizabeth, dẫn đến việc xét xử, kết án và xử tử Mary.
Công việc tình báo của Walsingham cũng sẽ chứng minh công cụ trong cuộc chiến sắp tới với Tây Ban Nha. Ông đã giúp che dấu sự chuẩn bị cho cuộc đột kích bất ngờ của Sir Francis Drake vào Cảng Cádiz vào tháng 4 năm 1587 bằng cách đưa ra một báo cáo sai sự thật về kế hoạch của Drake với đại sứ Anh tại Paris, người mà Walsingham đã phỏng đoán chính xác là trả cho người Tây Ban Nha. Nhiều điệp viên của Walsingham đã cung cấp các báo cáo chi tiết về sự chuẩn bị của Tây Ban Nha cho chuyến đi của Armada chống lại Anh vào tháng 7 năm 1588.
Walsingham đã kết hôn hai lần (cả hai lần với những người phụ nữ góa chồng): với Anne Barnes Carleill (đôi khi đánh vần Carlyle) vào năm 1562 và sau khi bà qua đời, với Ursula St. Barbe Worseley năm 1566. Con gái ông Frances (1567 ném1632) kết hôn hai lần trong số những nhân vật nổi bật nhất của vòng tròn bên trong của Elizabeth: nhà thơ và cận thần Sir Philip Sidney (1583) và Robert Devereux, bá tước thứ 2 của Essex (1590), một người yêu thích của Elizabeth đã bị xử tử vì tội phản quốc năm 1601 sau một âm mưu đảo chính. (Người chồng thứ ba của cô là Richard Burke, bá tước thứ 4 của Clanricarde.) Walsingham đã được cấp một số ưu đãi sinh lợi và tài sản từ vương miện, bao gồm cả trang viên của Barn Elms, gần Cung điện Richmond. Nhưng rõ ràng anh ta đã chết trong một khoản nợ đáng kể, một phần là do đã nhận các khoản nợ của bất động sản của Sidney.
