Trong những năm 1980 và 1990, Nhà nguyện Sistine đã trải qua một kế hoạch phục hồi lâu dài và công phu được tài trợ bởi một tập đoàn truyền hình Nhật Bản và được thực hiện bởi các chuyên gia hàng đầu của Ý và quốc tế. Việc dọn dẹp đã loại bỏ hàng thế kỷ bụi bẩn, bụi và khói nến từ các bức bích họa và tiết lộ màu sắc rực rỡ bất ngờ, một phần mâu thuẫn với phẩm chất điêu khắc nổi tiếng của kiệt tác của Michelangelo. Một cuộc tranh cãi gay gắt liên quan đến việc liên quan đến các nhà phục chế, nhà sử học nghệ thuật và các chuyên gia trong các lĩnh vực liên quan đã bao vây dự án ngay từ khi bắt đầu. Cuộc tranh luận tập trung vào một vấn đề chính: có phải Michelangelo, theo cách của các họa sĩ bích họa thời đó, đã sửa đổi bức bích họa đã hoàn thành của mình bằng sơn secco (khô) sau khi thạch cao khô? (Các họa sĩ Fresco thường làm điều này như một biện pháp sửa chữa sai lầm, tinh chỉnh các tác phẩm của họ và áp dụng các sắc tố không thể chịu được sự tiếp xúc với nước.) ? Trong trường hợp này, bóng, hiệu chỉnh và keo được loại bỏ bởi các nhà phục hồi dường như là kết quả của các chiến dịch phục hồi trước đó. Trong khi tranh cãi phục hồi nhà nguyện Sistine đôi khi vẫn còn được thảo luận, những người bảo tồn nghệ thuật không còn nghĩ đó là một vấn đề.
